বেফাকের লক্ষ্য ও উদ্দেশ্য

১।  (ক) বাংলাদেশের প্রচলিত কওমী মাদরাসাসমূহকে একটি ঐক্যসূত্রে গ্রথিত করা । 
    (খ) দ্বীন ইসলামের হিফাযত করা।
    (গ) তা'লীম তারবিয়াত, দাওয়াত ও তাবলীগ এবং এলায়ে কালিমাতুল্লাহর নিমিত্ত পারস্পরিক সাহায্য সহানুভূতির দ্বার সম্প্রসারণ করা। 
২।  কওমী মাদরাসাসমূহকে জনগণের নিকট তাদের একনিষ্ঠ ধর্মীয় খিদমতগার প্রতিষ্ঠান হিসেবে পরিচিত করানো ও তাদের প্রিয় করে তোলা ।  দ্বীনী শিক্ষা লাভের প্রতি দেশবাসীকে উৎসাহিত করে তোলা।
৩।  কওমী মাদরাসাসমূহকে বর্তমান যুগের সর্ব প্রকার ফেৎনা-ফাসাদ ও ইসলাম বিরোধী শক্তিসমূহের ষড়যন্ত্রের হাত থেকে রক্ষা করা।
৪।  কওমী মাদরাসাসমূহের তা'লীম ও তারবিয়াতের মান এবং নেছাবে তা'লীম ও তরীকায়ে তা'লীমের মান উন্নত করা ।
৫।  যোগ্য মুদাররিস সৃষ্টির জন্য প্রয়োজনীয় প্রশিক্ষণ দানের এবং উচ্চ শিক্ষার ব্যবস্থা করা।  প্রয়োজনে বিদেশে প্রেরণের ব্যবস্থা করা।
৬।  মুসলিম বিশ্বের বিভিন্ন দ্বীনী শিক্ষা প্রতিষ্ঠানের সাথে ঘনিষ্ঠ সম্পর্ক স্থাপন করা।
৭।  কওমী মাদরাসায় শিক্ষাপ্রাপ্ত উলামায়ে কিরামকে সমাজ জীবনে প্রতিষ্ঠিত করার জন্য বাস্তব পদক্ষেপ গ্রহণ করা। 
৮।  দ্বীনী আরবী শিক্ষার ক্ষেত্রে কওমী মাদরাসাসমূহের গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকার প্রতি সকল মহলের স্বীকৃতি আদায়ের চেষ্টা করা।
৯।  কওমী মাদরাসাসমূহের অর্থনৈতিক মানোন্নয়নের পন্থা উদ্ভাবন ও সম্ভাব্য সকল প্রকার ব্যবস্থা গ্রহণ করা। 
১০।  কওমী মাদরাসা শিক্ষার মানোন্নয়নকল্পে বেফাকের তত্ত্বাবধানে বিভিন্ন স্তরের কেন্দ্রীয় পরীক্ষা গ্রহণের ব্যবস্থা করা।
১১।  মাদরাসা শিক্ষার উন্নয়নকল্পে আরবী ভাষা এবং মাতৃভাষা বাংলার প্রতি যথাযথ গুরুত্বারোপ করা এবং এ জন্যে প্রয়োজনীয় ব্যবস্থা গ্রহণ করা।